【用总RNA跑电泳,rRNA是什么样子的条带?三条带是如何排列的?】在分子生物学实验中，总RNA的完整性是评估RNA质量的重要指标之一。通过琼脂糖凝胶电泳可以直观地观察到RNA的电泳图谱，其中rRNA（核糖体RNA）是最主要的成分，占总RNA的约80%。在标准的琼脂糖凝胶电泳中，rRNA会呈现为清晰的条带，这些条带的大小和位置有助于判断RNA是否完整。
一、rRNA在电泳中的表现
在常规的甲醛变性琼脂糖凝胶电泳中，总RNA会显示两条明显的主带，分别对应于18S和28S rRNA。此外，还可能看到一条较弱的5S rRNA条带。这三条带是判断RNA完整性的关键标志。
- 18S rRNA：约为2.0 kb
- 28S rRNA：约为4.5 kb
- 5S rRNA：约为0.12 kb
二、三条带的排列顺序
在电泳图谱中，从上到下（即从负极到正极），rRNA条带的排列顺序如下：
| 条带名称 | 大小（kb） | 在电泳图谱中的位置 | 特点 |
| 28S rRNA | 约4.5 | 上方 | 较强、清晰，常为最明显条带 |
| 18S rRNA | 约2.0 | 中间 | 次强，通常比28S略弱 |
| 5S rRNA | 约0.12 | 下方 | 最弱，有时不易观察 |
> 注意：5S rRNA在某些情况下可能不明显，尤其在RNA降解时容易消失。
三、如何判断RNA完整性？
1. 28S与18S的比例：正常情况下，28S条带应比18S强且清晰，若两者比例失调或18S条带模糊，则可能表示RNA降解。
2. 5S条带是否存在：5S rRNA的存在与否也可作为判断RNA完整性的辅助依据。
3. 背景是否干净：若电泳图谱中有大量弥散的条带或拖尾现象，说明RNA可能存在降解。
四、总结
在总RNA的琼脂糖凝胶电泳中，rRNA以三条主要条带的形式出现，分别是28S、18S和5S rRNA。它们从上到下的排列顺序为：28S > 18S > 5S。清晰、对称的条带表明RNA完整性良好，而条带模糊或缺失则提示RNA可能已降解。
| 项目 | 内容 |
| rRNA种类 | 28S、18S、5S |
| 条带位置 | 从上到下：28S、18S、5S |
| 条带强度 | 28S最强，18S次之，5S最弱 |
| 完整性判断 | 条带清晰、对称，无拖尾或弥散；28S与18S比例合适 |
通过这种直观的电泳分析，研究人员可以快速评估RNA的质量，为后续的实验（如反转录、PCR、测序等）提供可靠的材料基础。
